在农田上种树的问题，根据相关政策法规，主要由以下两个部门负责：1. 自然资源主管部门：负责土地资源的规划、管理和保护，包括耕地资源的合理利用和保护。2. 农业农村主管部门：负责农业生产的指导、管理和监督，包括耕地种植用途的管控。如果耕地上种树违反了相关法规，比如占用耕地进行非农业建设，相关部门可以责